Le guide aborde en 38 pages le fonctionnement d'un cours d'eau en relation avec la qualité physique et l'état écologique. Il traite également des altérations et de leurs conséquences (notamment barrages et seuils). Il se termine par les apports de la Directive Cadre sur l'Eau, les méthodes de restauration et un point sur la réglementation. Ce guide est notamment à destination des associations, des collectivités et des animateurs SAGE.