La Fédération des Parcs Naturels Régionaux de France, structure associative de Loi 1901, est le porte-parole du réseau des Parcs naturels régionaux dont les objectifs sont de :

• représenter les intérêts collectifs des Parcs naturels régionaux auprès des instances nationales et internationales
• participer à la définition et à la mise en œuvre de la politique en faveur des espaces ruraux français
• diffuser et faire connaître l’éthique des Parcs naturels régionaux et leurs actions, en France et à l’international.

Pour les mares, les zones humides intérieures (marais, étangs, lacs, têtes de bassins) et les vallées alluviales, la Fédération des Parcs Naturels Régionaux de France est en charge de l'animation du pôle-relais depuis juin 2009.